Publications in biophysics

2016

  1. French A. S., E.-V. Immonen, R.V. Frolov: Static and Dynamic Adaptation of Insect Photoreceptor Responses to Naturalistic Stimuli, Front. Physiol., 7, 477, 2016 [10.3389/fphys.2016.00477]
  2. Frolov R.V.: Current advances in invertebrate vision: insights from patch-clamp studies of photoreceptors in apposition eyes, J. Neurophysiol., 116, 709-723, 2016 [10.1152/jn.00288.2016]
  3. Frolov R.V., E.-V. Immonen, M. Weckström: Visual ecology and potassium conductances of insect photoreceptors, J. Neurophysiol., 115, 2147-2157, 2016 [10.1152/jn.00795.2015]
  4. Frolov R.V., M. Weckström: Harnessing the Flow of Excitation : TRP, Voltage-Gated Na+, and Voltage-Gated Ca2+ Channels in Contemporary Medicine, Adv. Prot. Chem. Str. Biol., 103, 25-95, 2016 [10.1016/bs.apcsb.2015.11.001]
  5. Rusanen J., M. Weckström: Frequency-selective transmission of graded signals in large monopolar neurons of blowfly Calliphora vicina compound eye, J. Neurophysiol., 115, 2052-2064, 2016 [10.1152/jn.00747.2015]

2015

  • French, A. S., Meisner, S., Liu, H., Weckstrom, M., & Torkkeli, P. H. (2015). Transcriptome analysis and RNA interference of cockroach phototransduction indicate three opsins and suggest a major role for TRPL channels. Frontiers in Physiology, 6, 207. [dx.doi.org/10.3389/fphys.2015.00207]
  • Therese Reber, Antti Vähäkainu, Emily Baird, Matti Weckström, Eric Warrant, and Marie Dacke (2015). Effect of light intensity on flight control and temporal properties of photoreceptors in bumblebees. J. exp. Biol 218, 1339-1346, 2015. []
  • Roman R Frolov and Satpal Singh (2015). Evidence of more ion channels inhibited by celecoxib: KV 1.3 and L-type Ca2+ channels. BMC Res Notes, 8, 62, 2015.[10.1186/s13104-015-1023-1]
  • Indices of arterial elasticity measured from axial distension of common carotid artery in relation to reference methods. H Yli-Ollila, T Laitinen, 2, M Weckström and T M Laitinen. Clin Physiol Funct Imag (in press).
  • Biophysical properties of photoreceptors in Corixa punctate. Roman V. Frolov. Vis Res 111, 75-81, 2015 [10.1016/j.visres.2015.03.026]

2014

  • Frolov R.V. , E.-V. Immonen, M. Weckström: Performance of blue- and green-sensitive photoreceptors of the cricket Gryllus bimaculatus, J. Comp. Physiol. A, 200, 209–219, 2014 [10.1007/s00359-013-0879-6]
  • Frolov R.V., S. Singh: Celecoxib and ion channels: A story of unexpected discoveries, Eur. J. Pharmacol., 730, 61–71, 2014 [10.1016/j.ejphar.2014.02.032]
  • Frolov R., Weckström M.: Developmental changes in biophysical properties of photoreceptors in the common water strider (Gerris lacustris): better performance at higher cost, J. Neurophysiol., 112, 913–922, 2014 [10.1152/jn.00239.2014]
  • Honkanen A., J. Takalo, K. Heimonen, M. Vähäsöyrinki, M. Weckstrom: Cockroach optomotor responses below single photon level, J. Exp. Biol., 217, 4262-4268, 2014 [10.1242/​jeb.118638 ]
  • Ignatova I., A.S. French, E.-V. Immonen, R. Frolov, M. Weckström: Equilibrating errors: reliable estimation of information transmission rates in biological systems with spectrum analysis-based methods, Biol. Cybern., 108, 305–320, 2014 [10.1007/s00422-014-0598-2]
  • Yli-Ollila, Heikki; Laitinen, Tomi; Weckstrom, Matti; Tarvainen, Mika P; Laitinen, Tiina (2014). Relation of arterial stiffness and axial motion of the carotid artery wall—A pilot study to test our motion tracking algorithm in practice, EMBC 2014:246 - 249 (10.1109/EMBC.2014.6943575)
  • Immonen E.-V., S. Krause, Y. Krause, R. Frolov, M.T. Vähäsöyrinki, M. Weckström: Elementary and macroscopic light-induced currents and their Ca2+-dependence in the photoreceptors of Periplaneta americana, Front. Physiol., 5, 153, 2014 [10.3389/fphys.2014.00153]

2013

  • Baden T., T. Euler, M. Weckström, L. Lagnado: Spikes and ribbon synapses in early vision, Trends Neurosci., 36, 480–488, 2013
  • Frolov R.V., S. Singh: Temperature and functional plasticity of L-type Ca2+ channels in Drosophila, Cell Calcium, 54, 287–294, 2013 [10.1016/j.ceca.2013.07.005]
  • Vähäkainu A, Vähäsöyrinki M, Weckström M. : Membrane filtering properties of the bumblebee Bombus terrestris photoreceptors across three spectral classes, J. Comp. Physiol. A, 199, 629–639, 2013 [10.1007/s00359-013-0814-x]
  • Yli-Ollila H., T. Laitinen, M. Weckström, T. Lyyra-Laitinen: Axial and Radial Waveforms in Common Carotid Artery: an Advanced Method for Studying Arterial Elastic Properties in Ultrasound Imaging, Ultrasound Med. Biol., 39, 1168–1177, 2013 [10.1016/j.ultrasmedbio.2013.01.018]

2012

  • Caruanaa C.J., M. Wasilewska-Radwanska, A. Aurengod, P.P. Dendye, V. Karenauskaite, M.R. Malisan, S. Mattson, J.H. Meijer, D. Mihov, V. Mornstein, E. Rokita, E. Vano, M. Weckstrom, M. Wucherer: A strategic development model for the role of the biomedical physicist in the education of healthcare professionals in Europe, Phys. Medica, 28, 307-318, 2012 [10.1016/j.ejmp.2011.05.001]
  • French A.S.: Transcriptome walking: A laboratory-oriented GUI-based approach to mRNA identification from deep-sequenced data, BMC Research Notes, in press, 2012
  • Frolov R., E.-V. Immonen, M. Vähäsöyrinki, M. Weckström : Postembryonic Developmental Changes in Photoreceptors of the Stick Insect Carausius morosus Enhance the Shift to an Adult Nocturnal Life-Style , J. Neurosci., 32, 16821-16831, 2012
  • Frolov R.V., A. Bagati, B. Casino, S. Singh : Potassium Channels in Drosophila: Historical Breakthroughs, Significance, and Perspectives, J. Neurogenet., 26, 275-290, 2012 [10.3109/01677063.2012.744990]
  • Frolov R.V., S. Singh: Inhibition of Ion Channels and Heart Beat in Drosophila by Selective COX-2 Inhibitor SC-791, PLoS ONE, 7, e38759:1-8, 2012 [10.1371/journal.pone.0038759]
  • Heimonen K., E.-V. Immonen, R. V. Frolov, I. Salmela, M. Juusola, M. Vähäsöyrinki, M. Weckström: Signal coding in cockroach photoreceptors is tuned to dim environments, J. Neurophysiol., 108, 2641-2652, 2012
  • Koivuniemi A., T. Vuorela, P.T. Kovanen, I. Vattulainen, M.T. Hyvönen: Lipid Exchange Mechanism of the Cholesteryl Ester Transfer Protein Clarified by Atomistic and Coarse-grained Simulations, PLoS Comput. Biol., 8, e1002299, 2012 [10.1371/journal.pcbi.1002299]
  • Manninen A.-L., A. Koivula, M. T. Nieminen: The applicability of radiophotoluminescence dosemeter (RPLD) for measuring medical radiation (MR) doses, Radiat. Prot. Dosim., 151, 1-9, 2012 [10.1093/rpd/ncr463]
  • Salmela I., E.-V. Immonen, R. Frolov, S. Krause, Y. Krause, M. Vahasoyrinki, M. Weckstrom : Cellular elements for seeing in the dark: voltage-dependent conductances in cockroach photoreceptors, BMC Neurosci., 13, 93, 2012 [10.1186/1471-2202-13-93]
  • Takalo J., A. Piironen, A. Honkanen, M. Lempeä, M. Aikio, T. Tuukkanen, M. Vähäsöyrinki : A fast and flexible panoramic virtual reality system for behavioural and electrophysiological experiments, Scientific Reports, 2, 324, 2012 [10.1038/srep00324]

2011

  • Cilpa G., A. Koivuniemi, M. T. Hyvnen, M.-L. Riekkola: A Molecular Dynamics Approach for the Association of ApolipoproteinB-100 and Chondroitin-6-sulfate, J. Phys. B, 115, 4818-4825, 2011 [10.1021/jp110987r]
  • Fink M., S.A. Niederer, E.M. Cherry, F.H. Fenton, J.T. Koivumäki, G. Seemann, R. Thul, H. Zhang, F.B. Sachse, D. Beard, E.J. Crampin, N.P.Smith: Cardiac cell modelling: Observations from the heart of the cardiac physiome project, Prog. Biophys. Mol. Biol., 104, 2-21, 2011 [10.1016/j.pbiomolbio.2010.03.002]
  • Frolov R.V., I.I. Ignatova, S. Singh: Inhibition of hERG Potassium Channels by Celecoxib and its Mechanism, PLoS ONE, 6 (10), e26344 (7 pp), 2011 [10.1371/journal.pone.0026344]
  • Murtola T., T.A. Vuorela, M.T. Hyvönen, S.-J. Marrink, M. Karttunen, I. Vattulainen : Low density lipoprotein: structure, dynamics, and interactions of apoB-100 with lipids, Soft Matter, 7, 8135-8141, 2011 [10.1039/C1SM05367A]
  • Piironen A., M. Weckström, M. Vähäsöyrinki: Ultra-small and customizable multichannel electrodes for extracellular recordings, J. Neurophysiol., 1416–1421, 2011 [10.1152/jn.00790.2010]
  • Takalo J, I. Ignatova, M. Weckström, M. Vähäsöyrinki: A novel estimator for the rate of Information transfer by continuous signals, PLoS ONE, 6(4), e18792, 2011 [10.1371/journal.pone.0018792]

2010

  • Aikio M., J. Takalo, M. Lempeä, M. Vähäsöyrinki: Hemispherical projection lens for insect behavior analysis, Proc. of SPIE, 7717, 771711 (8 pp), 2010 [10.1117/12.851340]
  • Caruana C.J., M. Wasilewska-Radwanska, A. Aurengo, P.P. Dendy, V. Karenauskaite, M.R. Malisan, J.H. Meijer, D. Mihov, V. Mornstein, E. Rokita, E. Vano, M. Weckstrom, M. Wucherer: A comprehensive SWOT audit of the role of the biomedical physicist in the education of healthcare professionals in Europe , Phys. Medica, 26, (2), 98-110, 2010 [10.1016/j.ejmp.2009.08.001]
  • Cilpa G., M.T. Hyvönen, A. Koivuniemi, M.-L. Riekkola: Atomistic Insight into Chondroitin-6-sulfate Glycosaminoglycan Chain Through Quantum Mechanics Calculations and Molecular Dynamics Simulation, J. Comput. Chem., 31, 1670-1680, 2010 [10.1002/jcc.21453]
  • Frolov R.V., I.I. Ignatova, S. Singh: Mechanism of K(v)2.1 channel inhibition by a selective COX-2 inhibitor SC-791-modification of gating, Brain Res., 1359, 67-74, 2010 [10.1016/j.brainres.2010.08.062]
  • Frolov R.V., V.E. Bondarenko, S. Singh: Mechanisms of Kv2.1 channel inhibition by celecoxib – modification of gating and channel block, Brit. J. Pharmacol., 159, 405-418, 2010 [10.1111/j.1476-5381.2009.00539.x]
  • Lähdesmäki K, O.H.S. Ollila, A. Koivuniemi, P.T. Kovanen, M.T. Hyvönen: Membrane simulations mimicking acidic pH reveal increased thickness and negative curvature in a bilayer consisting of lysophosphatidylcholines and free fatty acids, Biochim. Biophys. Acta-Biomembr., 1798, 938-946, 2010 [10.1016/j.bbamem.2010.01.020]
  • Stenlund L., K. Riski, J. Seppälä, M. Pudas, M. Vähäsöyrinki, V. Tuhkanen, J. Röning: Traceable characterization of a bending millimetre scale cantilever for nanoforce sensing, Meas. Sci. Technol. , 21, 075102:1-9, 2010 [10.1088/0957-0233/21/7/075102]
  • Vuorela T., A. Catte, P.S. Niemelä, A. Hall, M.T. Hyvönen, S.-J. Marrink, M. Karttunen, I. Vattulainen: Role of Lipids in Spheroidal High Density Lipoproteins, PLoS Comput. Biol., 6(10), e1000964 (14 pp), 2010 [10.1371/journal.pcbi.1000964]
  • Weckström M.: Intracellular recording, Scholarpedia, 5(8), 2224 (1 pp), 2010 [10.4249/scholarpedia.2224]
  • Weckström M., S.B. Laughlin: Extracellular potentials modify the transfer of information at photoreceptor output synapses in the blowfly compound eye, J. Neurosci., 30(28), 9557-9566, 2010 [10.1523/JNEUROSCI.6122-09.2010]
  • Yetukuri L., S. Söderlund, A. Koivuniemi, T. Seppänen-Laakso, P.S. Niemelä, M. Hyvönen, M.-R. Taskinen, I. Vattulainen, M. Jauhiainen, M. Orešič: Composition and Lipid Spatial Distribution of High Density Lipoprotein Particles in Subjects with Low and High HDL-cholesterol, J. Lipid. Res., 51:(8), 2341-2351, 2010 [10.1194/jlr.M006494]

2009

  • Koivumäki J., J. Takalo, T. Korhonen, P. Tavi, M. Weckström: Modelling sarcoplasmic reticulum calcium ATPase and its regulation in cardiac myocytes, Phil. Trans. R. Soc. A, 367, 2181-2202, 2009 [10.1098/rsta.2008.0304]
  • Koivumäki J.T., T. Korhonen, J. Takalo, M. Weckström, P. Tavi: Regulation of excitation-contraction coupling in mouse cardiac myocytes: integrative analysis with mathematical modelling, BMC Physiology, 9:16, 20 pages, 2009 [10.1186/1472-6793-9-16]
  • Koivuniemi A., M. Heikelä, P.T. Kovanen, I. Vattulainen, M.T. Hyvönen : Atomistic simulations of phosphatidylcholines and cholesteryl esters in high-density lipoprotein-sized lipid droplet and trilayer: Clues to cholesteryl ester transport and storage, Biophys J., 96, 4099-4108, 2009 [10.1016/j.bpj.2009.01.058]
  • Rokka A., V.D. Antonenkov, R. Soininen, H.L. Immonen, P.L. Pirilä, U. Bergmann, R.T. Sormunen, M. Weckström, R. Benz, J.K. Hiltunen: Pxmp2 is a channel-forming protein in mammalian peroxisomal membrane, PLoS ONE, 4(4), e5090:1-15, 2009 [10.1371/journal.pone.0005090]
  • Vähäsöyrinki M., T. Tuukkanen, H. Sorvoja, Marko Pudas: A minimally invasive displacement sensor for measuring brain micromotion in 3D with nanometer scale resolution, J Neurosci Meth, 180, 290-295, 2009 [10.1016/j.jneumeth.2009.04.004]

2008

  • Krause, Y., S. Krause, J. Huang, C. Liu, R. Hardie, and M. Weckström: Light-Dependent Modulation of Shab Channels via Phosphoinositide Depletion in Drosophila Photoreceptors, Neuron, 59, 596-607, 2008 [10.1016/j.neuron.2008.07.009]

2007

  • Grewe, J., M. Weckström, M. Egelhaaf and A.-K. Warzecha: Information and Discriminability as Measures of Reliability of Sensory Coding, PLoS ONE, 2(12): e1328, 2007 [10.1371/journal.pone.0001328]

2006

  • Heimonen, K., I. Salmela, P. Kontiokari, and M. Weckström: Large functional variability in cockroach photoreceptors: Optimization to low light levels, J. Neurosci., 26 (52), 13454-13462, 2006 [10.1523/JNEUROSCI.3767-06.2006]
  • Vähäsöyrinki, M., J.E. Niven, R.C. Hardie, M. Weckström, and M. Juusola : Robustness of neural coding in Drosophila Photoreceptors in the absence of slow delayed rectifier K+ channels , J. Neurosci., 26(10), 2652-2660, 2006 [10.1523/JNEUROSCI.3316-05.2006]

2005

  • Krause, S. and W. Schwarz: Identification and selective inhibition of the channel mode of the neuronal GABA transporter 1 , Mol. Pharmacol., 68(6), 1728-1735, 2005 [10.1124/mol.105.013870]

2004

  • Kauranen, M. and M. Weckström: K+ channels and their modulation by 5-HT in Drosophila photoreceptors : A modelling study, Ann. Biomed. Eng., 32, 1580 - 1595, 2004 [10.1114/B:ABME.0000049041.73308.63]
  • Mäkiranta, M.J., J. Ruohonen, K. Suominen, E. Sonkajärvi, T. Salomäki, V. Kiviniemi, T. Seppänen, S. Alahuhta, V. Jäntti, and O. Tervonen: BOLD-contrast functional MRI signal changes related to intermittent rhythmic delta activity in EEG during voluntary hyperventilation—simultaneous EEG and fMRI study, NeuroImage, 22, 222-231, 2004 [10.1016/j.neuroimage.2004.01.004]
  • Niven, J.E., M. Vähäsöyrinki, M. Juusola, and A.S. French: Interactions between light-induced currents, voltage-gated currents, and input signal properties in Drosophila photoreceptors, J. Neurophysiol., 91, 2696-706, 2004 [10.1152/jn.01163.2003]
  • Tavi, P., S. Pikkarainen, J. Ronkainen, P. Niemelä, M. Ilves, M. Weckström, O. Vuolteenaho, J. Bruton, H. Westerblad, and H. Ruskoaho: Pacing-induced calcineurin activation controls cardiac Ca2+ signalling and gene expression, J. Physiol. (Lond.), 554, 309-320, 2004 [10.1113/jphysiol.2003.053579]

2003

  • Dahlstedt, A.J., A. Katz, P. Tavi, and H. Westerblad: Creatine kinase injection restores contractile function in creatine-kinase-deficient mouse skeletal muscle fibres, J. Physiol. (Lond.), 547, 395-403, 2003 [10.1113/jphysiol.2002.034793]
  • Lehenkari, P., Parikka V, Rautiala T, Weckström M, Dahllund J, Härkönen P and Väänänen HK: The effects of tamoxifen and toremifen on bone cells involve changes in plasma membrane ion conductance, J. Bone Min. Res., 18, 473-481, 2003
  • Niven, J.E., M. Vähäsöyrinki, and M. Juusola : Shaker K+-channels are predicted to reduce the metabolic cost of neural information in Drosophila photoreceptors , Proc. R. Soc. B, 270, S58-S61, 2003 [10.1098/rsbl.2003.0010]
  • Niven J, Vähäsöyrinki M, Kauranen M, Hardie RC, Juusola M & Weckström M.: The contribution of Shaker potassium channels to the information capacity in Drosophila photoreceptors, Nature, 421, 630-634, 2003 [10.1038/nature01384]
  • Tavi, P., D.G. Allen, P. Niemelä, O. Vuolteenaho, M. Weckström and H. Westerblad: Calmodulin kinase modulates Ca2+ release in mouse skeletal muscle, J. Physiol. (Lond.), 551 (1), 5-12, 2003 [10.1113/jphysiol.2003.042002]
  • Voutilainen-Myllylä S, Weckström M & Tavi P.: Chelerythrine and bisindolyl-maleimide I prolong cardiac action potentials by protein kinase C-independent mechanism, Eur. J. Pharmacol., 466, 41-51, 2003 [10.1016/S0014-2999(03)01541-3]

2002

  • Han C, Tavi P and Weckström M.: Modulation of action potential by [Ca2+]i in modelled rat atrial and guinea-pig ventricular myocytes, Am. J. Physiol. Heart C., 282, H1047-H1054, 2002 [10.1152/ajpheart.00573.2001] >>
  • Han C, Tavi P and Weckström M.: Role of the Na+-Ca2+ exchanger as an alternative trigger in CICR in mammalian cardiac myocytes, Biophys J., 82, 1483-96, 2002 >>
  • Mäkiranta, M.J., J.P.T. Jauhiainen, J.T. Oikarinen, K. Suominen, O. Tervonen, S. Alahuhta, and V. Jäntti: Functional magnetic resonance imaging of swine brain during change in thiopental anesthesia into EEG burst-suppression level - a preliminary study, Magn. Reson. Mat. Phys. Biol. Med. , 15, 27-35, 2002 [10.1016/S1352-8661(02)00121-7 ]
  • Mäkiranta, M.J., S. Lehtinen, J.P.T. Jauhiainen, J.T. Oikarinen, J. Pyhtinen, and O. Tervonen: MR perfusion, diffusion and BOLD imaging of methotrexate-exposed swine brain, J. Magn. Reson., 15, 511-519, 2002 [10.1002/jmri.10103]

2001

  • Tavi P, Laine M, Weckström M, Ruskoaho H.: Cardiac mechano-transduction: From sensing to disease and treatment, Trends Pharmacol. Sci., 22, 254-260, 2001 [10.1016/S0165-6147(00)01679-5]

2000

  • Cronin T.W., Järvilehto M, Weckström M and Lall, A.B.: Tuning of photoreceptor spectral sensitivity in twilight-active and night-active firefly species (coleoptera:lampyridae), J. Comp. Physiol. A, 186, 1-12, 2000 [10.1007/s003590050001]
  • Tavi P, Weckström M, Ruskoaho H: cAMP- and cGMP-independent stretch-induced changes in the contraction of rat atrium, Pflügers Arch., 441, 65-68, 2000 [10.1007/s004240000403]
  • Uusitalo RO and Weckström M.: Dark recovery in a graded potential synapse: the role of potentiation and ionic mechanisms, J. Neurophysiol., 83, 2103-12, 2000 >>

1999

  • Han C., Tavi P., Weckström M.: Role of the sarcoplasmic reticulum in the modulation of rat cardiac action potential by stretch, Acta Physiol., 167, 111-117, 1999 [10.1046/j.1365-201x.1999.00598.x]
  • Klemola R, Huttunen P, Leppäluoto J & Weckström M.: Chatecholamine concentration in pericardial fluid and plasma in normotensive and spontaneously hypertensive rats, Acta Physiol., 165, 293-297, 1999 [10.1046/j.1365-201x.1999.00507.x]
  • Tavi, P., Han, C. and Weckström M: Intracellular acidosis modulates the stretch-induced changes in calcium balance, contraction force and action potentials, Acta Physiol., 167, 203-213, 1999 [10.1046/j.1365-201x.1999.00615.x]
  • Tavi P, Laine M, Voutilainen S, Lehenkari P, Vuolteenaho O, Ruskoaho H & Weckström M: Potentiation of strech-induced atrial natriuretic peptide secretion by intracellular acidosis, Am. J. Physiol. Heart C., 277, H405-H412, 1999

 

Refereed article in a book

  • Caruana, C.J., M. Wasilewska-Radwanska, A. Aurengo, P. P. Dendy, V. Karenauskaite, M. R. Malisan, J. H. Meijer, D. Mihov, V. Mornstein, E. Rokita, E. Vano, M. Weckström and M. Wucherer: EFOMP Project ’Biomedical Physics Education for the Healthcare Professions’ - An Update for WC2009 . Teoksessa World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering, September 7 - 12, 2009, Munich, Germany, General Subjects , toim. Olaf Dössel and Wolfgang C. Schlegel, IFMBE Proceedings, 141-144, 2009 [10.1007/978-3-642-03893-8_40]
  • Weckström, M. and P. Tavi: The mechanosensory heart: a multidisciplinary approach. Teoksessa Cardiac Mechanotransduction, toim. Matti Weckström and Pasi Tavi, Landes Bioscience, Springer Science+Business Media, 1-7, 2007 >>

 

doctoral thesis

  1. Honkanen, Anna (2014): Insect optomotor experiments in the dark using virtual reality >>
  2. Immonen, Esa-Ville (2014): In vitro electrophysiology of two nocturnal insect species, Periplaneta americana and Gryllus bimaculatus >>
  3. Salmela, Iikka (2013): Biophysics of Night Vision: Cockroach (Periplaneta americana) Photoreceptors as a Model System >>
  4. Takalo, Jouni (2013): Towards natural insect vision research >>
  5. Piironen, Arto (2011): Novel experimental methods for insect neurophysiology >>
  6. Koivumäki, Jussi (2009): Regulation of Excitation-Contraction Coupling in Cardiac Myocytes. Insights from Mathematical Modelling >>
  7. Heimonen, Kyösti (2008): Processing of visual information in dim light >>
  8. Vähäsöyrinki, Mikko (2004): Voltage-gated K+ channels in Drosophila photoreceptors >>
  9. Han, Chunlei (2001): Intracellular calcium stores and sodium-calcium exchanger in cardiac myocytes >>
  10. Hyvönen, Marja (2001): Molecular dynamics simulations on phospholipid membranes >>
  11. Tavi, Pasi (1999): Cellular mechanisms of atrial mechanotransduction
  12. Tikkanen, Pauli (1999): Characterization and application of analysis methods for ECG and time interval variability data
  13. Ying, Xiaoyou (1995): Digital imaging based measurements and analyses in quantitative biomedical research at cellular and microvascular levels
  14. Eskelinen, Sinikka (1986): Osmotic haemolysis of human erythrocytes. The effects of lysophosphatidylcholine, swelling rate and temperature

 

licentiate´s thesis

  1. Rouhiainen, Sini (2010): Geelidosimetrian sovelluksia
  2. Heikkilä, Vesa-Pekka (2005): Sädehoitoketjun virhelähteiden mittaaminen ja analysointi
  3. Katisko, Jani (2004): Optisesti neuronavigoitu ultraäänikuvaus intraoperatiivisessa magneettikuvausympäristössä
  4. Palmgren, Jan-Erik (2002): Sädehoidon hoitokuvien automaattinen analyysi
  5. Kauranen, Mika (2001): Jännieteaktivoituvien K+ -kanavien vaikutuksesta banaanikärpäsen (Drosophila Melanogaster) valoaistinsolun valovasteen ja solukalvon impedanssiin
  6. Laurinen, Outi (1997): Immobilisaatiosta aiheutuvan lihasatrofian tutkiminen emg-spektrin avulla
  7. Tikkanen, Pauli (1995): Sykevaihtelua kuvaavista parametreista (on the parameters describing heart rate variability)
  8. Turunen, Jarmo (1994): Lineaarisia ja epälineaarisia menetelmiä systeemiajattelussa (Linear and nonlinear methods in system thinking)
  9. Huotari, Matti (1992): Biologisen hajusensorin vasteiden mittaus- signaalien käsittelymenetelmän kehittäminen tutkimusta ja mallintamista varten
  10. Leskelä, Markku (1990): Paperin raaka-aineiden ja rakenteen vaikutus optisiin ominaisuuksiin – yksiulotteinen epäjatkuva säteilyn siirtymismalli
  11. Repo, Tapani (1989): Frost hardiness of forest trees (Metsäpuiden pakkaskestävyys)
  12. Ryymin, Pertti (1987): Kaasunlaimennusmenetelmän ja –laitteiston kehittäminen bio-(haju)-sensorin tutkimukseen
  13. Eskelinen, Sinikka (1984): Punasolun osmoottisen hemolyysin mekanismista

 

master´s thesis

  1. Hyvärinen, Matias (2014): Microscopic and calorimetric study on model membranes composed of binary phospholipid mixtures
  2. Jaula, Janne (2014): Project and quality management in physics research : a trip from academic adhocracy to the lean side of project management
  3. Oinas, Joonas (2014): Rustokudoksen infrapunaspektrien klusterianalyysi ja eri nivelrikkotasoisten nivelrustonäytteiden vertailu yksimuuttujamenetelmin
  4. Björnholm, Lassi (2013): Utilizing data parcellation by ICA in studying the effect of neuroleptic medication on brain′s white matter integrity
  5. Immonen, Ville (2013): Nivelrikon aiheuttamien luumuutosten kvantitatiivinen arviointi polven röntgenkuvista
  6. Karhula, Sakari (2013): Effects of vertical patient positioning and projection of the scout image to patient dose and image noise in computed tomography
  7. Kivelä, Tarja (2013): O-kaaren laadunvarmistusprotokolla
  8. Kotiaho, Antti (2013): Validation of MOSFET dosimeter for measuring absorbed and effective doses in diagnostic radiology
  9. Saari, Paulus (2013): Visuaalisten pigmenttien mikrospektrofotometria torakan (Periplaneta americana) verkkosilmässä
  10. Beis, Ioannis (2012): Modification of the physical properties of model phosphatidylcholine bilayers by diacylglycerol: a molecular dynamics simulations study
  11. Liuska, Mika (2012): Elämän fysiikka. Biofysiikan koulukohtaisen syventävän kurssin opetussuunnitelman laatiminen lukioon
  12. Päkkilä, Maria (2012): Riskielimien annoskertymä ja sen minimointi eturauhasen ulkoisessa sädehoidossa
  13. Tuunanen, Mika (2012): Calibration and Verification of a Sun-Induced fluorescence Spectral Camera
  14. Eneh, Chibuzor (2011): Mechanical Attrition of TiO2 Nanoparticles by an Agitator Bead Mill
  15. Hiltunen, Tuija (2011): Täysikaistaisen EEG:n itsenäisten komponenttien korrelaatio BOLD-kontrastin kanssa lepotilassa
  16. Ignatova, Irina (2011): Time delay in signal processing of Drosophila melanogaster, Drosophila virilis and Calliphora vicina photoreceptors
  17. Puhakka, Pia (2011): Magnetic resonance image quality of three clinical scanners and determination of scanner specific action limits
  18. Rusanen, Juha (2011): Jänniteherkkien kaliumkanavien vaikutus raatokärpäsen Calliphora vicina suurten monopolaarisolujen impedanssiin
  19. Vähäkainu, Antti (2011): Näköaistinsolujen solukalvon jännitekohina ja input-resistanssi kimalaisessa (Bombus terrestris)
  20. Yli-Ollila, Heikki (2011): Ultraäänikuvantamiseen perustuvan kaulavaltimon jäykkyysmittausohjelman kehitys ja validointi
  21. Ålander, Elisa (2011): Simulaattorin kartiokeilatietokonetomografin käyttö sädeannossuunnittelussa
  22. Metsikkö, Heidi (2010): Hengitystahdistetut sädehoidot
  23. Salo, Elli-Noora (2010): Tekninen kuvanlaatu ja säteilyannos suoradigitaalisissa röntgenlaitteistoissa
  24. Immonen, Esa-Ville (2009): Contribution of Voltage-gated K+ Channels to Performance of Dissociated Photoreceptors of Periplaneta Americana
  25. Autio, Mikko (2008): Hyperspektraalinen kuvantava fluoresenssispektroskopia
  26. Hietala, Henna (2008): Lonkkaproteesi sädehoidon annossuunnittelun virhelähteenä - vaikutus annosjakaumaan >>
  27. Kokkonen, Annukka (2008): Matalakenttäisen magneettikuvauslaitteen soveltuvuus geelidosimetriaan
  28. Kuokkanen, Maija (2008): Dielektroforeesi 2D-elektrodigeometriassa
  29. Majava, Aila (2008): Näytetilavuuden vaikutus verikaasu-, elektrolyytti- ja laktaattiarvoihin käytettäessä Rapidlab 865-versikaasuanalysaattoria ja Rapidlyte -verikaasuruiskuja
  30. Manninen, Anna-Leena (2008): Radiofotoluminesenssidosimerien soveltuvuus lääketieteellisten säteilyannosten mittaukseen
  31. Takalo, Jouni (2008): Cardiac myocyte efficiency in silico
  32. Antikainen, Juho (2007): Transport Triggered Architecture Implementation of List Sphere Detector
  33. Lepola, Pasi (2007): Analysis of somatosensory evoked potentials and stimulus evoked bursts: Experimental study with a chronic porcine model
  34. Salmela, Iikka (2007): Compartmental modelling of photoreceptors of the cockroach
  35. Suorsa, Niina (2007): Neulapakkatekniikkaan perustuva implantointilaitteisto eturauhasen sisäiseen sädehoitoon
  36. Varanka, Matti (2007): Estimating running performance from physiological data
  37. Korhonen, Topi (2006): Development of a mathematical model of excitation-contraction coupling in mouse ventricular myocyte
  38. Lipponen, Juha (2006): Light-induced voltage oscillations in the photoreceptors of Drosophila melanogaster trpl302 mutant
  39. Piironen, Arto (2006): Dual recordings of the visual motion pathway of the fly
  40. Tuokila, Heidi (2006): Human balance estimation using wireless 3D acceleration sensor network >>
  41. Kemppainen, Santtu (2005): Orgaanisen aineksen biologisen hajoavuuden arvioiminen matemaattiseen malliin perustuvan menetelmän avulla >>
  42. Mattila, Sini (2005): Geelidosimetria intensiteettimuokatun sädehoidon verifioinnissa
  43. Tiinanen, Suvi (2005): Baroreflex Sensitivity: Assessment and Effect of Adaptive Filtering
  44. Mednichihina, Julia (2004): Physical Characterization of New Bio-Optical Materials >>
  45. Mehtätalo, Pentti (2004): Puun laadun määritys mikroaaltointerferometrillä >>
  46. Ollitervo, Sanna (2004): Optical Biosensors >>
  47. Pulkkinen, Pasi (2004): Biomechanical Properties of Bone in the Immobilization Model of Mouse >>
  48. Tenitz, Seppo (2004): Laskevakalvohaihduttimen valvova ohjaus neurosumean mallin avulla >>
  49. Mikkonen, Anna-Kaisa (2003): Turvepohjaisten pintavalutuskenttien hydrauliikka >>
  50. Niva, Arto Juhani (2003): Energiankulutuksen arviointi matalilla aktiivisuustasoilla
  51. Paksuniemi, Kristiina (2003): Leikkaussalin ja teho-osaston potilasmonitoroinnin langattomat anturi- ja tiedonsiirtoratkaisut >>
  52. Vähäsöyrinki, Mikko (2003): The contribution of Shaker K+ -channels to the properties of Drosophila photoreceptors: a modelling study >>
  53. Elsilä, Anne (2002): Lääketieteen tekniikan sovelluksia langattomassa tietoyhteiskunnassa
  54. Hakkarainen, Marko (2002): Fingerprint image quality estimation by texture classification methods >>
  55. Herrala, Mika (2002): Normaalikuntoisen, väsyneen ja kohonneen lepotonuksen omaavan lihaksen neuraalisten vasteiden vertailu >>
  56. Niemelä, Perttu (2002): Foam Tomography and Deformation Modelling >>
  57. Pietikäinen, Marianne (2002): Imaging spectroscopy in fluorescence measurements of living cells >>
  58. Sakari, Jukka-Pekka (2002): Natriumglukonaatin entsymaattisen tuottoprosessin mallintaminen >>
  59. Aario, Salla (2001): Kasvin hyvinvoinnin määritys heijastusspektristä >>
  60. Haarto, Terhi (2001): Feasible Applications of MRI-controlled Hyperthermia >>
  61. Hirvonen, Kati (2001): Video- ja Elektro-Okulografian yhdistäminen silmänliikemittauksissa >>
  62. Koivumäki, Jussi (2001): Signal Quality Measurements in the Link Adaptation of Adaptive Multi-Rate Speech Channels in the GSM System
  63. Korhonen, Johanna (2001): Video Decoder for an Embedded System
  64. Moilanen, Tuula-Liina (2001): Pellettipatjan mallintaminen huokoisena materiaalina >>
  65. Pikkujämsä, Kalle (2001): From Data to Information - Visualisation of Sensor Data in Small Display
  66. Rintala, Jaana (2001): Huuhtoumamalli maankäytön muutosten vaikutusten arviointiin boreaalisilla jokivaluma-alueilla >>
  67. Alasaarela, Risto (2000): Äänen laadun analyysi GSM-tukiaseman ABIS-rajapinnassa >>
  68. Haho, Saara (2000): MIR-ATR -menetelmän soveltuvuus paperin päällystyspastan sideainepitoisuuden ja kiintoainepitoisuuden määrittämiseen >>
  69. Mäkelä, Satu-Marja (2000): Modelling of a passive dendritic spine in large monopolar cells of the fly compound eye >>
  70. Oikarinen, Eeva-Liisa (2000): Porrasaskelluksen reaktiovoimat terveillä koehenkilöillä ja polviartroosipotilailla >>
  71. Ryhänen, Tuula (2000): Hengitystielimakalvon värekarvatoiminta ja sen mittauslaitteiston kehittäminen >>
  72. Sorjamaa, Riikka (2000): Model for gross and net photosynthesis of scots pine >>
  73. Xin, Weidong (2000): Computer simulation of cardiac sodium-potassium pump >>
  74. Honkala, Lauri (1999): Aallokemuunnoksen käyttö EKG-signaalin proarytmia-analyysiin >>
  75. Leppänen, Kirsi (1999): Hiilimonoksidin adsorption desorption simulointi palladiumpinnoilla >>
  76. Mäntyjärvi, Jani (1999): Context recognition with sensorfusion and SOM
  77. Nurkkala, Miia (1999): Hiilimonoksidin hapettumisreaktion simulointi tinadioksidipinnalla >>
  78. Siimes, Katri (1999): Torjunta-aineiden huuhtoutumismallin testaus >>
  79. Särkelä, Mika (1999): Adaptiiviseen segmentointiin perustuva purskevaimentuman ilmaisu EEG-signaalista
  80. Hevonoja, Tiia-Elina (1998): Proton nuclear magnetic resonance spectroscopy as a method to study lipoprotein particle fusion >>
  81. Jaskari, Mareena (1998): Digitaalinen intraoraalinen hammasröntgenkuvaus >>
  82. Juopperi, Saara (1998): Phosphorus and phytoplankton behaviour in Gorg Blau >>
  83. Koskinen, Miika (1998): Purskevaimentuma-EEG:n topografia: aika-, spektri- ja bispektrianalyysi >>
  84. Lotvonen, Sami (1998): Construction and tuning of a fussy system with genetic algorithms and linguistic equations >>
  85. Ruikka, Ville (1998): Aallokemuunnos ja sen soveltaminen EKG:n proarytmia-analyysiin >>
  86. Salo, Mirja (1998): ECG tachogram editing for heart rate variability analysis >>
  87. Tuhkanen, Hanna-Riikka (1998): Maan orgaanisen fosforin mallintaminen ICECREAM-mallilla >>
  88. Uusitalo, Pekka (1998): Hiilimustalla seostetun muovielektrodin rakenne ja sähköiset ominaisuudet
  89. Katisko, Jani (1997): Endoskooppisen ultraäänianturin kehittäminen neurokirurgian sovellusalueelle >>
  90. Kinnunen, Hannu (1997): Quality of Ambulatory Heart Rate Variability Data and Artifact Correction
  91. Kivistö, Tellervo (1997): Interferometrinen biosensori - entsyymien immobilisointi natriumsilikaattilasille >>
  92. Mäkiranta, Minna (1997): Spantaneous Transmitter Release in Rat Neuromuscular Junction- Exploring the Origin of "Giant" Miniature End-Plate Potentials >>
  93. Oikarinen, Ari (1997): Tuulen jäähdyttävän vaikutuksen mallintaminen >>
  94. Palmgren, Jan-Erik (1997): EKG signaalin aallokemuunnosanalyysi
  95. Rasilainen, Kai (1997): a/b-mallin soveltaminen käytännön sädehoitoon >>
  96. Kylmänen, Raija (1996): Optisen kuidun pinnoitus biotiini-avidiinitekniikalla biosensorisovelluksiin >>
  97. Mäkelä, Timo (1996): Tietokoneistetun ultraäänimittausmenetelmän kehittäminen ja kudosnäytteiden sironta- ja vaimennusominaisuuksien mittaus >>
  98. Rinta-Paavola, Anneli (1996): Detection of reverberation artefacts in ultrasound imaging with correlation method: Theoretical and clinical application >>
  99. Vieltojärvi, Olli-Pekka (1996): Pölyn leviämismallin soveltaminen Raahen seudulle >>
  100. Anttonen, Lassi (1995): Koko kehon altistus tärinälle ja kylmälle >>
  101. Iinatti, Heini (1995): Maatalousalueiden valuman, eroosion ja ravinnehuuhtoumien mallintaminen >>
  102. Karhu, Sirpa (1995): Salicylaldoxime blocks potassium and calcium currents in rat cardiac myocytes >>
  103. Mattila, Kimmo (1995): Wagleriinien molekyylimallinnus laskennallisin ja NMR-menetelmin 2, Rakenteen dynamiikka ja Gly 10 -substituution vaikutus >>
  104. Ruusila, Ani (1995): Metsätalouden vaikutusta huuhtoumaan kuvaavia malleja, esimerkkinä Tilanjoen valuma-alueen kunnostusojitus >>
  105. Toivanen, Anna-Liisa (1995): Sokerijuurikkaan satoennustemallin laatiminen hermoverkkoja hyväksikäyttäen >>
  106. Yrjänä, Sanna (1995): Biophysical aspects of uterine contractions >>
  107. Huttunen, Harri (1994): Immunoreaktion mittaaminen SPR-matriisissa
  108. Hyvönen, Marja (1994): Wagleriinien molekyylimalli laskennallisin ja NMR menetelmin 1. Simulaatiot vesiliuoksessa >>
  109. Juntura, Esa (1994): Perämeren resuspensiomalli >>
  110. Karhula, Virpi (1994): Sädehoidon simulaattorin kuvausjärjestelmän kehittäminen >>
  111. Kauranen, Mika (1994): Patch-clamp -tutkimus ihmisen melanoomasolun ionikanavista >>
  112. Keränen, Mika (1994): 3D-hiilenkiertomalli vesiekosysteemille >>
  113. Kettunen, Petteri (1994): Immunologically motivated CA simulation of autocatalytic reactions >>
  114. Ollikainen, Sari (1994): Systeemimalli harjoittelun vaikutuksesta urheilusuoritukseen >>
  115. Laitinen, Anne (1992): Valupulverien viskositeetin mittausmenetelmät >>
  116. Talvitie, Päivi (1992): Hematokriitin ja liuottimen osmoottisen paineen vaikutus NMR-relaksaatioaikoihin punasolususpensioissa >>
  117. Heikkilä, Vesa-Pekka (1991): Non-invasiivisen, oskillometrisen verenpainemittarin jatkokehittely >>
  118. Mikkonen, Heimo (1991): Fotodynaaminen terapia >>
  119. Perttula, Severi (1991): Lämmönsiirron mallintaminen tuuli- ja kosteusolosuhteissa sylinterin muotoiselle kerrosvaatetukselle >>
  120. Viluksela, Marja (1991): Menetelmä kilpailevan immunoassayreaktion evaluointiin esimerkkinä testosteroni-FIA >>
  121. Vääräniemi, Jukka (1991): Paperikoneen kiertoveden mikrobien mittaus virtaussytometrilla >>
  122. Haapamäki, Juha (1990): Pohjoissuomalaisiin järviin soveltuva kasviplanktonmalli >>
  123. Hiltunen, Erkki (1990): Virtaussytometrin käyttö selluloosakuidun ominaisuuksien tutkimisessa >>
  124. Pyykkönen, Pirjo (1990): Reologisten mittausten hyödyntäminen maitopohjaisten tuotteiden kehitystyössä >>
  125. Tyni, Tuula (1990): Hengitysvirtausnopeuden ja -paineen mittaus sekä niistä johdettavat suureet potilasmonitoroinnissa >>
  126. Arponen, Rauno (1989): Koiran olfaktometrin kehittely ja testaus >>
  127. Järvinen, Heikki (1989): Konduktometria paperiteollisuudessa käytettyjen biosidien tehonmäärityksissä >>
  128. Ylinärä, Tuomo (1989): Vesivirran nopeuden ja pakoreaktiovoiman mittaaminen vaelluskalan uintitutkimuksessa >>
  129. Hyvärinen, Tuomo (1988): Juoksijan rasitusvammojen ennaltaehkäisy kenkävalinnan avulla ja valintamenetelmän kehitystyö >>
  130. Majaniemi, Antti (1988): Begonian mikrolisäysmenetelmän kasvutekijöiden tutkiminen ja matemaattinen mallintaminen nesteviljelyolosuhteissa >>
  131. Ojala, Esa (1988): Korkeataajuisen melun vaikutusten analysointi audiometrian ja simpukan mallien avulla >>
  132. Rimpeläinen, Seija (1988): Rasitus-EKG:n ja dynaamisen radiokardiografian käyttö sepelvaltimotaudin vaikeusasteen määrittelyssä ja kahden havaitsijan välinen ero analysoitaessa dynaamisia isotooppitutkimuksia >>
  133. Strömmer, Mikko (1988): Happiselektiivisen ilmaisimen konstruointi kaasukromatografille >>
  134. Tolonen, Rauno (1988): Hieskoivuvesakon varhaiskehityksen dynamiikka ja pituuskasvun mallintaminen >>
  135. Turunen, Jarmo (1988): Analogiatietokonejärjestelmän tarkkuudesta ja sen kokeellisesta määrittämisestä >>
  136. Virtanen, Jukka (1988): Hissin elementtimalli ja sen käyttö ajomukavuuden arvioinnissa >>
  137. Heikkinen, Pekka (1987): Glukonaattifermentoinnin dynaaminen mallintaminen >>
  138. Hyytiä, Hille (1987): Rinnakkais- ja jälkisaostus sulfaattiselluloosatehtaan jäteveden fosforin poistossa. Pilot-kokeita >>
  139. Leskelä, Markku (1987): Vesistön kompartmenttimalli ja sen käyttö jätevesien purkuvesistön kunnostusmenetelmien vaikutusten arvioinnissa >>
  140. Tuulari, Esa (1987): Automaattinen sykevälianalyysi kardiovaskulaaristen heijasteiden tutkimuksessa >>
  141. Laakso, Pasi (1986): Etanolin ja 4-aminopyridiinin vaikutus motoriseen suorituskykyyn ja hippocampuksen herätepotentiaaliin eräillä standardi- ja jalostetuilla rottakannoilla >>
  142. Siekkinen, Jari (1986): Sydämen vasemman kammion absoluuttinen tilavuusmittaus geometrisella ja ei-geometrisella menetelmällä >>
  143. Hiltunen, Esa Veikko (1985): Tekoaltaan talvista happitilannetta ennustava malli: Analogiatietokonesovellutuksena Uljuan tekoaltaan happitilanteen simulointi vuosina 1971 - 1979 >>
  144. Huttunen, Jukka (1985): Kasvuturpeen vesipitoisuus ja sen mittausmenetelmän kehittäminen >>
  145. Kemppainen, Lauri (1985): Metsän avohakkuun ja maanmuokkauksen aiheuttamat muutokset maaperän lämpö- ja kosteusoloissa sekä niiden vaikutus männyn taimien kasvuun >>
  146. Ollila, Kari (1985): Aivojen sähköisen aktiivisuuden kartoitusmenetelmä >>
  147. Tolonen, Pertti (1985): Tasajännitepulssin indusoiman solufuusion toteuttamiseen soveltuvan laitteiston kehittäminen ja testaus >>
  148. Virta, Pirkko (1985): Uljuan altaan vaikutus Siikajoen veden laatuun ja ainetaseisiin >>
  149. Haataja, Seppo (1984): Selän kuormituksen kenttäkelpoisen mittausmenetelmän kehittäminen EMG-tekniikkaa soveltaen >>
  150. Lahti-Nuuttila, Kimmo (1984): Biolietteen käsittelyn vaihtoehdot ja sellutehtaan jätevedenpuhdistamon aktiivilietteen anaerobinen mädätys >>
  151. Wuokko, Anne (1984): Metaboliamittauslaitteiston kehittäminen >>
  152. Erkkilä, Jouni (1983): Instrumentointijärjestelmä bioanturin systeemianalyyttistä tarkastelua varten >>
  153. Repo, Tapani (1983): Männynversosyövälle alttiiden ja vastustuskykyisten taimialkuperien erottaminen. Neulasten ominaisimpedanssin mittaus >>
  154. Huotari, Matti (1982): Bioanturit ja niiden dynamiikka: Hermostosysteemin logiikan tarkastelu >>
  155. Huttu-Hiltunen, Esko (1982): Ultraääniterapialaitteen äänipään työhygieeninen selvitys >>
  156. Miesmaa, Outi (1982): Elektroninen mittausmenetelmä PTB-Proteesin sopivuutta tutkittaessa >>
  157. Ryymin, Pertti (1982): Bioanturit ja niiden dynamiikka - Mekanoreseptorin kvantitatiivinen tarkastelu >>
  158. Aho, Juha (1979): Suoraan osoittavat pölymittarit >>

 

Last updated: 30.1.2017